Нелинейная физика ДНК

Description

НЕЛИНЕЙНАЯ ФИЗИКА ДНК ......Page 1 http://shop.rcd.ru ......Page 2 Оглавление ......Page 10 1.1. Химический состав и первичная структура ......Page 15 н5 г3 ......Page 16 1.2• Пространственная геометрия и вторичная структура ......Page 18 1.3. Силы, стабилизирующие вторичную структуру ДНК ......Page 19 1.3.1. Водородные взаимодействия ......Page 20 1.3.2. Стэкинговые взаимодействия ......Page 21 1.3.3. Дальнодействующие силы внутри и снаружи сахарофосфатного остова ......Page 22 1.4. Полиморфизм ......Page 23 1.5. Третичная структура ......Page 25 1.5.2. Структурная организация в клетках ......Page 26 1.6. Моделирование структуры ДНК ......Page 27 1.6.1. Общие замечания ......Page 28 1.6.2. Иерархия структурных моделей ......Page 29 1.7. Экспериментальные методы исследования структуры ДНК ......Page 34 2.1. Общая картина внутренней подвижности ДНК ......Page 36 2.2. Крутильные и изгибные движения ......Page 39 2.3.2. Возможные движения оснований ......Page 41 2.4.2. Возможные движения сахарофосфатного остова ......Page 44 tg Р= ({I/1 + VA) - (1/3 + щ)) /З.О81/2; ......Page 45 2.5.1. В —► А-переход ......Page 47 2.5.2. В —> Z-переход ......Page 48 2.6.1. Раскрытие пар оснований вследствие вращения оснований ......Page 49 2.7. Моделирование динамики ДНК ......Page 50 2.7.2. Иерархия динамических моделей ......Page 51 2.8Д. Раман-спектроскопия ......Page 54 2.8.2. Рассеяние нейтронов ......Page 56 2.8.3. Инфракрасная спектроскопия ......Page 58 2.8.4. Водородно-дейтериевый (-тритиевый) обмен ......Page 59 2.8.6. ЯМР ......Page 60 2.8.7. Эксперименты по переносу заряда ......Page 61 2.8.8. Эксперименты с отдельными молекулами ......Page 62 3.1. Физические аспекты функционирования ДНК ......Page 63 3.2. Интеркаляция ......Page 65 3.3. Белок-нуклеиновое узнавание ......Page 66 3.4. Экспрессия генома ......Page 67 3.5. Регуляция генной экспрессии ......Page 70 с) ......Page 71 3.6. Репликация ......Page 72 4.1. Основные математические модели ......Page 74 4.1.1.1. Продольные и крутильные движения: дискретный случай ......Page 75 4.1.1.3. Изгибные движения ......Page 80 4.1.2. Линейная модель двойного упругого стержня ......Page 81 Я« = £ {/2 + к(^+и - ^)2/2}; ......Page 82 рй2 = +a(ui -U2); ......Page 84 4.1.3. Линейные модели более высоких уровней иерархии ......Page 85 4.1.3.1. Модели третьего уровня ......Page 86 4.1.3.2. Модели четвертого уровня (решеточные модели) ......Page 87 4.2.1.1. Общее решение модельных уравнений ......Page 88 4.2.1.2. Представление вторичного квантования ......Page 90 (МО)А' (*)) = ф(0) ,%(*)); ......Page 91 4.2.2. Фононы в модели двойного стержня ......Page 92 :::::: ......Page 93 4.2.2.1. Общее решение модельных уравнений ......Page 94 4.2.2.2. Представление вторичного квантования ......Page 96 4.2.2.3. Корреляционные функции ......Page 97 4.2.3. Фононы в моделях более высокого уровня ......Page 98 V = (2тг712/т) J2 Bn>i5 (r ~