Основы физики макромолекул

Description

Учебное пособие. – СПб: Университет ИТМО, 2015. – 74 с.Пособие адресовано для студентов, обучающихся по направлениям 16.04.01 «Техническая физика», 18.04.02 «Энерго- и ресурсосберегающие процессы в химической технологии, нефтехимии и биотехнологии» и 19.04.01 «Биотехнология»Содержит общие положения о статистических свойствах и динамике макромолекул, а также о моделировании полимерных систем.СодержаниеВведениеСтатистические свойства макромолекулМногообразие макромолекулМодели полимерной цепиМодель свободно-сочлененной цепи Модель цепи с фиксированными валентными углами Приближенные модели для реальных цепей Модель персистентной (червеобразной) цепиОбщие свойства идеальных (гауссовых) цепейЭффекты исключенного объема в полимерном клубке Набухание полимерного клубка в хорошем растворителеСвойства самонепересекающих цепей Качество растворителя (идеальный и набухшему клубок) Динамика макромолекулПоворотно-изомерные переходыМодель Рауза и Модель Зимма Влияние концентрации на динамикуРептационная модель Коэффициент диффузии Характеристическая вязкостьМаксимальное время релаксации Вязкоупругость. Релаксационный модульМолекулярно-динамическое моделирования полимерных системМоделирование одноатомных газовМолекулярная динамика. Уравнения движения НьютонаСтохастическая динамика Броуновская динамикаПотенциалы взаимодействия для одноатомных молекулПериодические граничные условия Статистические ансамбли и термостатированиеТермостат БерендсенаТермостат масштабирования скоростей Термостат Нозе-ГувераБаростатированиеБаростат БерендсенаБаростат Парринелло-РаманаЗадание начальных координат молекул Общий алгоритм МД расчета для одноатомных газовМоделирование полимерных молекулМеханические модели полимерных цепейЗадание начальных конформаций сложных молекул Минимизация энергии системыАлгоритм МД расчетов для сложных молекулОбработка результатов Список использованных источниковПриложение. Вывод некоторых уравнений полимерной динамики для моделей Рауза и Зима