Diagnostics to pathogenomics of sexually transmitted infections

Description

Title Page......Page 5 Copyright Page......Page 6 Contents......Page 7 About the Editor – Prof. Sunit K. Singh......Page 17 Contributors......Page 19 Preface......Page 23 1.1 Introduction......Page 25 1.2.1 Humoral Defense Factors in Female Secretions......Page 26 1.3.1 Female Genital Tract Secretions......Page 28 1.3.2 Origin of Igs in Human Genital Tract Secretions......Page 31 1.3.3 Functions of Genital Tract Antibodies......Page 32 1.4.2 Immunoglobulin‐Producing Cells......Page 34 1.4.3 T Cells and Other Cell Types......Page 35 1.5 Induction of Immune Responses in the Genital Tract......Page 36 1.5.1 Induction of Humoral Immune Responses in Human Male Genital Tract Secretions......Page 38 1.5.2.2 Chlamydia......Page 39 1.5.2.4 Human Papilloma Virus......Page 40 References......Page 41 2.2 Biological Mechanisms......Page 51 2.4 Complications......Page 52 2.5.2 Female‐to‐Male Transmission......Page 53 2.6 Human Papilloma Virus (HPV)......Page 54 2.7.1 Gonorrhea......Page 55 2.8 Ulcerative STIs/Genital Ulcer Disease (GUD)......Page 56 2.8.1 Syphilis......Page 57 2.9 Use of Male Circumcision as a Public Health Measure......Page 58 2.10 Female Genital Mutilation (FGM)......Page 59 References......Page 60 3.1 Introduction......Page 65 3.2 Definition of Probiotics......Page 67 3.3 Vaginal Microflora (Microbiota)......Page 70 3.4 Applications of Probiotics in Vaginal and Reproductive Health......Page 73 3.4.1 Vaginitis (Aerobic Vaginitis (AV), Bacterial Vaginosis (BV), and Vulvovaginal Candidiasis (VVC))......Page 74 3.4.3 Pregnancy......Page 76 3.5 Conclusions......Page 77 References......Page 78 4.1 Introduction......Page 85 4.2 HIV Structure/Genome......Page 86 4.3.1.1 STDs and Sexual Transmission of HIV......Page 88 4.3.1.2 Vulnerability of Female Genital Tract for HIV Transmission......Page 90 4.3.5 Occupational Risk in Healthcare Workers......Page 92 4.4.2 Local Host Factors......Page 93 4.5 Viral Factors Influencing HIV Infectivity in Sexual Transmission......Page 94 4.6 Mechanism of Pathogenesis......Page 95 4.7 Diagnosis of HIV Infections......Page 96 4.8.1 Antiretroviral Therapies (ARTs)......Page 97 4.9 Conclusion......Page 98 References......Page 99 5.2 Pathogen......Page 107 5.4 Pathogenesis and Immunity......Page 108 5.5 Clinical Features......Page 110 5.6 Diagnosis......Page 111 5.7 Treatment......Page 114 5.8 Prevention and Control......Page 117 5.9 Conclusion......Page 118 References......Page 119 6.2 Epidemiology......Page 125 6.3 Molecular Pathogenesis......Page 126 6.4 Diagnosis......Page 127 6.5 Clinical Features......Page 130 6.7 Treatment......Page 131 6.7.1.1 Watchful Waiting......Page 132 6.7.1.2 Procedure‐Based Treatments......Page 133 6.7.1.3 Chemical Agents......Page 134 6.7.1.4 Immune Modulators......Page 135 6.7.1.6 Immunocompromised Patients......Page 136 References......Page 137 7.2.1 Taxonomy......Page 143 7.2.5 Clearance......Page 144 7.4.1 Risk Factors......Page 145 7.5.1 Physical Signs......Page 146 7.5.2 Symptoms......Page 147 7.6.3 Histopathology......Page 148 7.7 Differential Diagnosis......Page 149 7.8.1 Cryotherapy......Page 150 7.8.7 Imiquimod (3.75% or 5% cream)......Page 151 7.9.3 Children......Page 153 7.10 HPV Vaccination......Page 154 References......Page 155 8.2 Epidemiology......Page 159 8.3.1 The Attachment and Entry of Chlamydial EBs......Page 160 8.3.3 Chlamydial Replication and Persistence......Page 161 8.4 Clinical Features......Page 162 8.4.2 Female Urogenital Tract......Page 163 8.4.3 Infection and Pregnancy......Page 165 8.4.4 Male Urogenital Tract......Page 166 8.4.5 Anorectal Tract Infections......Page 167 8.4.7 Lymphogranuloma Venereum......Page 168 8.5.1 Pathogenesis of Female Genital Tract Chlamydial Infections......Page 169 8.5.3 Upper FRT Pathogenesis......Page 170 8.5.6 Chlamydial Infections of the Upper MRT......Page 172 8.5.8 Chlamydial Orchitis......Page 173 8.6 Diagnosis and Treatment......Page 174 8.7 Prevention and Control......Page 175 8.8 Conclusion......Page 176 References......Page 177 9.1 Introduction......Page 191 9.3 Pathology......Page 192 9.4 Incubation Period......Page 193 9.5 Clinical Pictures......Page 194 9.6 Sites of Involvement......Page 198 9.8 Diagnosis......Page 199 9.10 Treatment......Page 200 9.11 Prevention and Control......Page 201 References......Page 202 10.1 Introduction......Page 205 10.2.1 Morphology......Page 206 10.2.2.2 Por Proteins......Page 207 10.2.2.5 Lipooligosaccharide (LOS)......Page 208 10.3 Pathogenesis and Immunity......Page 209 10.4 Epidemiology......Page 210 10.5.3 Extragenital Locations......Page 212 10.6.1 Samples......Page 213 10.6.3 Culture......Page 215 10.6.5 Neisseria gonorrhoeae Genotyping......Page 217 10.6.6 Nucleic Acid Amplification Tests (NAATs)......Page 221 10.7 Treatment......Page 222 10.8 Prevention and Control......Page 224 References......Page 226 11.1 Introduction......Page 235 11.2 Genetics of TPA and TEN Strains......Page 236 11.3 Virulence Factors of Syphilis and Bejel......Page 238 11.4 Diagnostics of Syphilis and Bejel......Page 239 11.5 Treatment of Syphilis and Bejel......Page 241 11.6 Molecular Typing of Syphilis and Bejel Treponemes......Page 244 11.7 Vaccine Development for Syphilis and Bejel......Page 246 References......Page 247 12.1 Introduction......Page 257 12.2 Biology......Page 258 12.3 Pathogenesis......Page 259 12.3.3 Production of Enzymes......Page 260 12.4 Epidemiology......Page 261 12.5.1.1 Bacterial Vaginosis......Page 262 12.5.1.3 Pelvic Inflammatory Disease (PID) and Its Sequalae......Page 263 12.5.1.4 Infections in Pregnancy......Page 264 12.5.2.3 Infertility......Page 265 12.5.3.3 Infection in Immunocompromised Patients......Page 266 12.6.2 Culture Methods......Page 267 12.6.3 Molecular Methods......Page 269 12.6.4 Serology......Page 270 12.7 Treatment......Page 271 12.8 Prevention and Control......Page 272 References......Page 273 13.1 Introduction......Page 281 13.2 Implication of G. vaginalis in Bacterial Vaginosis......Page 282 13.3 Epidemiology and Risk Factors......Page 284 13.4 Pathogenesis and Immunity......Page 285 13.6 Diagnosis......Page 287 13.7 Treatment......Page 290 References......Page 292 14.2 Epidemiology of Chancroid and H. ducreyi......Page 301 14.3 Clinical Features......Page 302 14.4 The Pathogen......Page 303 14.5.2 Virulence Mechanisms......Page 304 14.5.3 Regulation of Virulence......Page 306 14.5.4 Immune Response......Page 307 14.6 Diagnosis, Treatment, and Prevention......Page 308 14.7 Chronic Limb Ulcers Caused by H. ducreyi......Page 309 14.8 Conclusions......Page 310 References......Page 311 15.2.1 Pathogens......Page 317 15.3.1.1 Asymptomatic Colonization......Page 318 15.3.1.2 Symptomatic Infection......Page 319 15.3.4 Young and Elderly Women......Page 322 15.4.2 Pregnancy......Page 324 15.4.4 Genetic Predisposition......Page 325 15.4.4.3 AIRE Mutation......Page 326 15.4.4.7 Mannose‐Binding Lectin (MBL)......Page 328 15.5.1 Acute/Episodic Infection......Page 329 15.6.2 Clinical Examination......Page 330 15.6.3 Wet Mount Microscopy......Page 331 15.6.4 Vaginal pH......Page 333 15.6.8 Differential Diagnosis......Page 334 15.7.2 Treatment of Uncomplicated Acute Infection......Page 335 15.7.3 Treatment of Complicated Acute Infection......Page 336 15.7.3.2 Non‐Albicans Candida Infection......Page 338 15.7.3.4 Pregnancy and Breastfeeding......Page 339 15.7.4 Recurrent Vulvovaginal Candidiasis (RVVC)......Page 340 15.7.4.2 Elimination of Risk Factors of Recurrence in RVVC Patients......Page 341 15.7.4.3 Underlying Reasons for Failing Maintenance Therapy......Page 342 References......Page 343 16.1 Introduction......Page 353 16.2 Etiology and Epidemiology......Page 354 16.4 Transmission......Page 355 16.5.3 Host Factors......Page 356 16.5.5 Clinical Features......Page 357 16.5.6.3 White Paint Dots and Pseudomembranous Tinea......Page 359 16.7.1 Direct Examination......Page 360 16.8.2 Systemic......Page 361 16.9 Conclusion......Page 362 References......Page 363 17.1 Introduction......Page 365 17.2 Epidemiology of T. vaginalis......Page 366 17.3 HIV and Trichomonas......Page 368 17.4 Biology and Pathogenesis of T. vaginalis......Page 369 17.5 Clinical Features of T. vaginalis Infection......Page 370 17.6 Diagnosis of T. vaginalis......Page 372 17.6.1 Laboratory Diagnosis......Page 373 17.7 Treatment of T. vaginalis......Page 374 References......Page 375 18.2 Epidemiology......Page 381 18.3 Etiopathogenesis......Page 382 18.4 Clinical Features......Page 383 18.5.2 Dermatoscopy/Videodermatoscopy......Page 387 18.5.3 Histopathology......Page 389 18.6.1 Topical Agents......Page 390 18.6.3 Treatment for Crusted Scabies......Page 391 References......Page 392 Index......Page 397 Supplemental Images......Page 417 EULA......Page 443