ABC da Simulação Computacional

Description

Sumário......Page 5 Introdução......Page 9 Dinâmica Molecular......Page 11 Propósito e Organização do Livro......Page 12 Breve Revisão da Mecânica Clássica......Page 13 Leis de Conservação......Page 14 Formalismo Hamiltoniano......Page 17 O Operador de Liouville......Page 19 Introdução......Page 23 Mecânica Estatística Clássica......Page 24 Ensemble Micro-Canônico......Page 25 Ensemble Canônico......Page 26 Propriedades Termodinâmicas......Page 29 Propriedades Estruturais......Page 36 Propridades Dinâmicas......Page 42 Potenciais de Interação......Page 49 Esfera Dura......Page 50 Potencial de Sutherland......Page 51 Potencial de Born......Page 52 Potencial de Lennard-Jones......Page 53 Potencial de Morse......Page 54 Potencial de Buckingham......Page 55 Potencial de Tersoff......Page 56 Potencial de Stillinger-Weber......Page 57 Potencial Embedded Atom......Page 58 Aproximação de Segundo Momento Tight-Binding......Page 60 Outros potenciais......Page 61 Modelo Físico......Page 63 Condições de Contorno ......Page 64 Convenção de Mínima Imagem......Page 67 O Cálculo do Potencial de Interação e Força - um exemplo......Page 68 Deslocamento do Potencial......Page 71 Condições Iniciais......Page 72 Medida de observáveis......Page 77 Escolha do passo de integração......Page 78 Simulando Fora do Ensemble Microcanônico......Page 81 Pressão constante com o método de Andersen......Page 82 Tensão constante com o método de Parrinello-Rahman......Page 84 Aplicação ao caso de pressão hidrostática......Page 86 Aplicação ao caso de tensão geral......Page 89 Temperatura constante usando Nosé-Hoover-Chain......Page 91 Temperatura constante pela dinâmica de Langevin......Page 94 Monte Carlo em Física Estatística Clássica......Page 97 Quadratura usando métodos de Monte Carlo......Page 98 Cálculo de propriedades termodinâmicas......Page 100 Amostragem seletiva e balanço detalhado......Page 101 Exemplo: gás de osciladores......Page 104 Modelo de Heisenberg Clássico......Page 109 Algoritmo Wang-Landau......Page 122 Introdução......Page 129 Message Passing Interface (MPI)......Page 130 Decomposição espacial......Page 135 Identidade escalar e vetorial......Page 136 Cópia de átomos vizinhos......Page 138 Lista de células encadeadas......Page 143 Cálculo do potencial e Força de muitos corpos......Page 145 Migração entre processadores......Page 146 Lista de modificações no código serial......Page 148 Balanço de carga......Page 150 Cálculo de propriedades durante a simulação em paralelo......Page 152 Deslocamento quadrático médio e coeficiente de difusão......Page 153 Termos utilizados ou traduzidos......Page 154 Programas exemplo utilizando chamadas básicas de MPI......Page 157 Erros no cálculo das propriedades......Page 165 Erro sobre as médias no equilíbrio......Page 166 Erro nas funções de correlação temporal......Page 167 Advento do computador - Linha do tempo......Page 169