Evolución: El Curso de la Vida

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Del Prefacio: Las ideas de Charles Darwin, retocadas y ratificadas por la síntesis evolutiva moderna, derivan de las tenebrosas proyecciones sociopolíticas de Malthus. Esta visión sombría provocó en Darwin un giro isomórfico que retroalimenta al modelo neoliberal de explotación planetaria y humana. La tensión entre ciencia, política e intereses económicos, se señala a menudo en la obra. El neodarwinismo transgrede el razonamiento deductivo mediante una axiomatización sui generis que, además, presume linearidad entre el genotipo y el fenotipo y usa modelos ideales de equilibrio para explicar un fenómeno intrínsecamente dinámico. Su modelo génico-poblacional es básico y extrapolacionista. Utiliza las mutaciones como fuente de variación y a la selección natural como creadora y conductora de un proceso de perfección incesante...El Curso de la Vida debe utilizar y reordenar el conocimiento actual, concediendo importancia a los fenómenos genéticos más recurrentes de la historia de los seres vivientes (i.e., hibridización, singamia, TGL). La evolución es intrínsecamente un proceso de intercambios genéticos, sea por vías sexuadas o asexuadas. Su comprensión no se logrará por analizar la arquitectura biológica resultante, sino por entender el proceso que le da forma... Prólogo......Page 13 Prefacio a la Segunda Edición......Page 19 Introducción......Page 23 Primera parte: El Curso de la Vida......Page 35 Capítulo 1 Origen y Crecimiento del Pensamiento Evolutivo......Page 37 Georges-Louis Leclerc, Comte de Buffon......Page 40 Jean-Baptiste Lamarck......Page 41 Patrick Matthew......Page 43 Ernst Haeckel......Page 44 Sir Richard Owen......Page 45 Los viajes de Wallace y su trabajo......Page 46 Wallace y la selección natural......Page 50 La controversia sobre la correspondencia entre Wallace y Darwin......Page 53 La carrera posterior de Wallace......Page 56 Las ideas de Charles Darwin (1809-1882)......Page 58 Argumentos que apoyan la evolución......Page 63 Externalismo versus internalismo......Page 68 Capítulo 2 Historia Planetaria y Vida Primigenia......Page 71 Fósiles y la explosión del Cámbrico......Page 74 Burgess Shale......Page 78 Colonización del ambiente terrestre......Page 86 El contexto histórico de la evolución de los cordados......Page 87 Extinciones masivas......Page 93 Extinción del Ordovícico (hace 440 Ma)......Page 94 Extinción del Cretácico (hace 65 Ma)......Page 95 Extinciones del Pleistoceno (100.000 años atrás)......Page 96 Capítulo 3 Sistemas Complejos y Orígenes del Orden......Page 97 El modelo de la complejidad......Page 100 El pensamiento complejo......Page 101 Teoría general de sistemas......Page 102 Estructuras disipativas......Page 103 Origen del orden y autoorganización de la materia......Page 105 Teoría del Caos......Page 107 Geometría fractal de la naturaleza......Page 108 Gaia: el Planeta Viviente......Page 109 El modelo de las margaritas......Page 110 Capítulo 4 Síntesis Moderna o Neodarwinismo......Page 113 Adaptacionismo......Page 118 El gradualismo filético......Page 120 Equilibrios intermitentes......Page 121 Selección de especies......Page 123 La darwinización de Mendel......Page 126 La neodarwinización de la ecología......Page 128 Capítulo 5 Equilibrio Poblacional......Page 131 La visión poblacional de la evolución......Page 135 El axioma de Hardy-Weinberg como principio antievolutivo......Page 138 Mutación......Page 140 Mutaciones adaptativas......Page 141 Cálculo de la adecuación biológica (w) y del coeficiente de selección (s)......Page 143 Selección total contra un alelo dominante......Page 145 Selección natural, modelos genético-cuantitativos y la evolución de la plasticidad fenotípica......Page 146 Selección estabilizante o normalizante......Page 147 Selección diversificante o disruptiva y mantención de los polimorfismos balanceados......Page 148 Carga genética y costo de la selección......Page 150 Endogamia......Page 151 Coeficiente de endogamia (F)......Page 152 Cambios aleatorios en las frecuencias alélicas: deriva génica (σ)......Page 154 Cuellos de botella demográficos y genéticos producidos por erupción volcánica......Page 156 Poblaciones y biología de la conservación......Page 157 Tamaño poblacional efectivo (Ne)......Page 158 Influencia de las fluctuaciones poblacionales sobre el Ne......Page 159 Efecto fundador......Page 161 Controversias poblacionales......Page 162 Estructura poblacional y la contienda entre la hipótesis clásica versus la del balance......Page 163 Origen de la variación......Page 164 Genética cuantitativa......Page 168 Selección natural y genética cuantitativa......Page 170 El origen de la endotermia......Page 171 Loci de rasgos cuantitativos (QTL)......Page 173 Capítulo 6 Especies y Especiación: Realidad, Proceso y Resultado......Page 175 Las especies......Page 177 El concepto biológico de especie......Page 181 Concepto fenético de especie......Page 183 Las especies bacterianas......Page 184 Especiación......Page 186 Especiación mediante hibridización......Page 187 Especiación mediante duplicación genómica total: alopoliploidía......Page 190 El modelo alopátrico convencional......Page 191 Modelo de especiación cuántico o peripátrico......Page 192 Especiación por efecto fundador......Page 193 Especiación simpátrica......Page 194 Especies en anillo......Page 196 Experimentos de laboratorio en especiación......Page 197 Especies y radiación adaptativa......Page 198 Realidad de las especies......Page 199 Genómica y especiación......Page 201 Cómo procede el origen de las especies......Page 202 Consideraciones epistemológicas sobre la especiación......Page 203 Capítulo 7 Sistemática e Inducción Filogenética......Page 205 Transformación de los caracteres......Page 209 Cladogramas y árboles......Page 211 Árboles enraizados y no enraizados......Page 213 Filogenia, sistemática y homología......Page 215 Escuelas de clasificación......Page 216 Observaciones, rasgos y evidencias en el pensamiento filogenético......Page 218 Inferencia filogenética......Page 219 Método de distancia Jukes Cantor......Page 220 Ejemplo de un análisis de distancia......Page 221 Máxima parsimonia......Page 222 Duplicación génica y homología molecular......Page 223 Pasos hacia una nueva concepción filogenética......Page 224 Reticulación......Page 228 Análisis de la diversidad genética mediante redes......Page 230 Capítulo 8 Descendencia con Modificación y el Árbol de la Vida......Page 233 Plantae......Page 240 Panorama actual de la clasificación animal......Page 245 El árbol de la vida......Page 248 Capítulo 9 Biogeografía, Deriva Continental y Migraciones......Page 253 Carolus Linnaeus (Linneo)......Page 256 Alexander von Humboldt......Page 257 Origen de los continentes......Page 258 Deriva continental......Page 261 Tectónica de placas......Page 263 Disgregación del supercontinente Pangea......Page 264 Escuela dispersionista......Page 267 Vicarianza......Page 268 Cladogramas de área......Page 269 Regiones o reinos biogeográficos......Page 272 Filogeografía y teoría de coalescencia......Page 274 Teoría de coalescencia......Page 275 Biogeografía de islas......Page 279 El Gran Intercambio Biótico Americano (GIBA)......Page 280 Eventos tectónicos, climáticos y bióticos asociados al Gran Intercambio Biótico Latinoamericano......Page 284 Orogénesis de los Andes y GIBA......Page 285 Indicadores biogeográficos: Nothofagus......Page 287 La Amazonía través del tiempo......Page 288 Mares interiores, Pebas y la biota sudamericana......Page 289 Origen de las gallinas en Sudamérica......Page 290 Origen y evolución de los marsupiales......Page 291 Patagonia, glaciaciones cíclicas y desplazamientos bióticos......Page 292 Alteraciones climáticas y bióticas en el extremo austral del Cono Sur......Page 294 Poblamiento humano de América......Page 296 Huellas genéticas humanas......Page 297 La ruta de migración costera......Page 298 El origen híbrido de Homo sapiens......Page 302 Contrastación de hipótesis en biogeografía......Page 305 Capítulo 10 Cromosomas y Herencia Vertical......Page 309 Centrómeros......Page 315 Traslocaciones robertsonianas......Page 318 Diferencias cromosómicas y especies crípticas en jerbos del género Taterillus......Page 319 El modelo de especiación cromosómica......Page 320 Ingeniería evolutiva y especiación cromosómica......Page 323 Especiación por poliploidía......Page 324 Transformación de los sistemas de determinación del sexo......Page 328 Determinación del sexo sin Sry y sin cromosoma Y......Page 330 Compensación de dosis e inactivación del cromosoma X en mamíferos euterios......Page 331 Estimación del número cromosómico ancestral de los vertebrados......Page 334 Capítulo 11 Transformaciones Moleculares y Genómicas......Page 339 Teoría neutral de evolución molecular......Page 342 El Reloj Molecular......Page 345 Los genes de eucariontes......Page 348 Tasas de sustitución nucleotídica......Page 350 Elementos no codificantes y cambios genéticos rápidos y neutros......Page 354 Duplicación génica y adaptación......Page 356 Evolución concertada......Page 359 Un delirio reduccionista: el gen como unidad evolutiva......Page 360 Secuencias repetidas, LINES y la evolución del genoma......Page 362 Evolución genómica y la paradoja del Valor C......Page 363 Diatomeas......Page 371 Plantas......Page 372 Paramecium tetraurelia......Page 373 Ctenóforos......Page 375 Cefalópodos......Page 376 Tunicados......Page 377 El genoma de amphioxus (Branchiostoma floridae)......Page 378 Genomas de peces......Page 379 El genoma de la gallina......Page 380 El genoma del ornitorrinco (Ornithorhynchus anatinus)......Page 381 El genoma marsupial......Page 382 El genoma de los euterios: la rata (Rattus rattus)......Page 384 El genoma humano (Homo sapiens) y del chimpancé (Pan troglodytes)......Page 385 El genoma antes y después de la secuenciación......Page 389 Silenciamiento génico......Page 391 Segunda parte: Otro Curso de la Vida......Page 395 Capítulo 12 Macroevolución......Page 397 Introducción......Page 399 Transferencia lateral de genes: flujo génico a través de la biosfera......Page 404 Transferencia de genes, cromosomas y genomas completos......Page 408 Origen asexual de especies poliploides por TGL......Page 409 Transferencia lateral de genes a través del Árbol de la Vida......Page 410 Adquisición de adaptaciones complejas por transferencia génica lateral......Page 412 Alopoliploidía: hibridización de linajes y duplicación genómica total......Page 415 Hipótesis 2R, 3R y 5R......Page 416 Poliploidía en bacterias......Page 419 El caso del roedor imposible......Page 420 Hipótesis 2R de poliploidización en los vertebrados......Page 423 Hipotesis 5R en vegetales......Page 427 El paradójico origen de los Phyla......Page 429 Cirripedia......Page 434 Rhyzocephala......Page 436 A la caza de la realidad: el controvertido origen de las larvas......Page 438 Incongruencias larvarias......Page 440 Phyla animales con larva trocófora: poliquetos, equiuroideos, sipunculoideos y moluscos......Page 442 Origen del lofóforo y de las quimeras......Page 445 Experimentos de hibridización entre ascidias y erizos de mar......Page 447 Radiación macroevolutiva de los mamíferos euterios......Page 450 Capítulo 13 Novedades Evolutivas......Page 455 Introducción......Page 457 El Dominio Archaea......Page 461 El pangenoma bacteriano......Page 462 El sistema CRISPR-Cas y la inmunidad lamarckiana......Page 464 Percepción mayoritaria (quorum sensing)......Page 467 El origen de la multicelularidad......Page 469 Multicelularidad naciente: las esponjas......Page 471 Origen de los sistemas neurales: los ctenóforos......Page 473 Origen de los cnidocitos de Cnidaria......Page 474 Origen de los Eucariontes......Page 475 Origen del núcleo......Page 479 Acerca del origen de las plantas......Page 480 Novedades del desarrollo y las raíces de Evo-Devo......Page 484 Novedades ontogenéticas......Page 485 Biología molecular del desarrollo......Page 489 La epigénesis......Page 492 Mecanismos epigenéticos......Page 493 Regulación génica en cis......Page 494 La orquestación del desarrollo en Drosophila melanogaster......Page 497 Los genes Hox en Drosophila melanogaster......Page 501 Los genes Hox en mamíferos......Page 503 Origen de la cabeza y del cerebro de los vertebrados......Page 504 Regulación génica y relojes circadianos......Page 505 Reclutamiento génico (coopción)......Page 506 La ontogenia vegetal......Page 507 Homologías profundas......Page 508 Modularidad......Page 509 Inferencia ontogenética: el ancestro Urbilaterio......Page 511 Reorganización genómica, metamorfosis y macroevolución en insectos holometábolos......Page 512 El paradigma evolutivo Evo-Devo......Page 513 Aproximación macroevolutiva a la descendencia con modificación......Page 514 Éxtasis y agonía de los genes Hox......Page 518 Evolución de los rasgos complejos......Page 522 Emergencia, sistemas complejos y origen de la vida......Page 527 Vida primigenia......Page 530 El origen de la vida......Page 534 El monstruo de Spiegelman......Page 538 Algunas definiciones de vida......Page 539 Capítulo 14 Epistemología, Contexto Histórico y Teoría Evolutiva Actual......Page 543 Adam Smith, el libre mercado y la economía de la naturaleza......Page 545 Herbert Spencer (1820-1903) y la sobrevivencia del más apto......Page 548 La doctrina del shock, Malthus y la eugenesia......Page 550 Darwin al desnudo......Page 554 Darwinismo social. Un ejemplo......Page 556 La estructura de la síntesis evolutiva y sus limitaciones......Page 559 Desdén por la macroevolución......Page 562 La vida como un campo de batalla......Page 563 El sojuzgamiento de la naturaleza......Page 564 Quimerismo y argumentación post hoc......Page 565 Explicación ambiental en referencia a los Rhizocephala (Crustacea, Cirripedia)......Page 566 Domesticación de Evo-Devo......Page 567 Hipótesis ecológicas sobre la explosión del Cámbrico......Page 568 Interpretaciones filogenéticas......Page 569 La visión de recepción de la teoría evolutiva......Page 570 Thomas H. Huxley......Page 571 St. George Mivart......Page 572 La teoría sintética de la evolución como sistema axiomático......Page 574 Principios axiomáticos......Page 575 Axiomas darwinianos y neodarwinianos......Page 576 La vision semántica de la teoría evolutiva......Page 582 Modelos biológicos......Page 588 El método hipotético-deductivo......Page 589 Creacionismo y evolución......Page 592 Diseño Inteligente: el nuevo atuendo del creacionismo......Page 594 Sociobiología o la biologización de las ciencias sociales......Page 595 Capítulo 15 Naturaleza y Ética......Page 597 Simbiosis, holobiontes y singamia......Page 599 Endosimbiosis y el genoma de las algas......Page 605 ¿Origen simbiótico de Cnidaria?......Page 607 Holobiontes y hologenomas......Page 608 Caracterización de los holobiontes y sus hologenomas......Page 609 Quimerismo......Page 610 Singamia, fusión genómica y el origen de la diversidad biótica......Page 614 Gaia: la metáfora del Planeta Viviente......Page 620 El mundo de las margaritas y consideraciones epistemológicas......Page 623 Biología para un nuevo siglo......Page 627 ¿Dos imperios o tres dominios?......Page 631 El árbol de la vida y el ancestro universal......Page 634 Teoría de la célula......Page 635 Ciencia y humanismo: la visión de Erwin Schrödinger......Page 638 Ciencia y humanismo......Page 641 La visión organísmica de Ludwig von Bertalanffy......Page 644 Hacia una física de los sistemas biológicos......Page 646 El concepto de naturaleza......Page 650 Naturaleza y ética......Page 652 Coda......Page 654 Apéndices......Page 657 Glosario......Page 659 Literatura citada......Page 672 Índice alfabético......Page 718